RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID3A	Q99856	593 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SCARF1	Q14162	830 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CLIP1	P30622	1438 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM5C	P41229	1560 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RASA1	P20936	1047 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CLDN10	P78369	228 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RELB	Q01201	579 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SPINT1	O43278	529 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	BMP1	P13497	986 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PSME1	Q06323	249 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.02	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP10A	O60312	1499 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PRU2	124 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	LCE2B	O14633	110 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	BMP2	P12643	396 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	CLN3	Q13286	438 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	SIX5	Q8N196	739 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L21	D6R901	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ATG7	O95352	703 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	SCNN1D	P51172	638 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	PTK7	Q13308	1070 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	CDCA8	Q53HL2	280 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	INHA	P05111	366 aa		11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	GDF10	P55107	478 aa		11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	IL2RA	P01589	272 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCC1	P33527	1531 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	MEN1	O00255	615 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	DKK1	O94907	266 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PDE4D-222	ENST00000514552	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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