RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.02■□□□□ 0.79
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NISCH-213ENST00000489895 TOM1O60784 492 aa20.01■□□□□ 0.79
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-213ENST00000489895 C8orf76Q96K31 380 aa19.92■□□□□ 0.78
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NISCH-213ENST00000489895 HMG20BQ9P0W2 317 aa19.91■□□□□ 0.78
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NISCH-213ENST00000489895 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
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NISCH-213ENST00000489895 DEF6Q9H4E7 631 aa19.91■□□□□ 0.78
NISCH-213ENST00000489895 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-213ENST00000489895 C6orf229H3BNL8 230 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-213ENST00000489895 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 154.8
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NISCH-213ENST00000489895 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
NISCH-213ENST00000489895 GOLIM4O00461 696 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 KSR2Q6VAB6 950 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 ST5P78524 1137 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-213ENST00000489895 TTC22Q5TAA0 569 aa19.89■□□□□ 0.77
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