RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 CNTNAP1P78357 1384 aa21.74■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 NFKBIEO00221 500 aa21.73■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.72■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.71■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 ERFEQ4G0M1 354 aa21.7■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.7■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 H0YIN7 160 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 MTHFSP49914 203 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 LBX1P52954 281 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 NFIXQ14938 502 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 CDCA8Q53HL2 280 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 POLKQ9UBT6 870 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.69■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 SERPINB2P05120 415 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 POTEIP0CG38 1075 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 POTEJP0CG39 1038 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 ABHD8Q96I13 439 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 TJP1Q07157 1748 aa21.68■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 VEGFBP49765 207 aa21.67■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.67■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.66■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.66■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.64■■□□□ 1.06
SRPRB-204ENST00000484684 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.64■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 WBP1LQ9NX94 342 aa21.64■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 NARFQ9UHQ1 456 aa21.64■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.63■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 C21orf2O43822 256 aa21.63■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.63■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 COL15A1P39059 1388 aa21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 PASKQ96RG2 1323 aa21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 LDHDQ86WU2 507 aa21.62■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.6■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.6■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.59■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.58■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.58■■□□□ 1.05
SRPRB-204ENST00000484684 PDE6BP35913 854 aa21.57■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.57■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.56■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.56■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.55■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.55■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.54■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.54■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 RASSF10A6NK89 507 aa21.53■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.52■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.52■■□□□ 1.04
SRPRB-204ENST00000484684 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 SCN4AP35499 1836 aa21.51■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 SLC39A6Q13433 755 aa21.51■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 SOGA3Q5TF21 947 aa21.51■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 NPHP1O15259 732 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 RGS19P49795 217 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 CNKSR1Q969H4 720 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.5■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 CFAP44Q96MT7 982 aa21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 HACL1Q9UJ83 578 aa21.49■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 A0A087WZG4 1122 aa21.48■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.48■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 EPHX2P34913 555 aa21.47■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 CNTROBQ8N137 903 aa21.47■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 STYK1Q6J9G0 422 aa21.46■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 LGR6Q9HBX8 967 aa21.46■■□□□ 1.03
SRPRB-204ENST00000484684 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms