RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DCTPP1Q9H773 170 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 TMX3Q96JJ7 454 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 NPHP1O15259 732 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 SDSP20132 328 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.51■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD44Q8N8A2 993 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3R4Q99570 1358 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 ANXA1P04083 346 aa19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 KIF20AO95235 890 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ4P48050 445 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 TTC22Q5TAA0 569 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 USP48Q86UV5 1035 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 FLT4P35916 1363 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC17AQ6ZS10 378 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 TECPR2O15040 1411 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 HOXC9P31274 260 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 FLIIQ13045 1269 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 RTL1A6NKG5 1358 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 TBX22Q9Y458 520 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 PSME1Q06323 249 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.46■□□□□ 0.71
CCSAP-204ENST00000483092 ERC2O15083 957 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 MCCP23508 829 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 IL17REQ8NFR9 667 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 REREQ9P2R6 1566 aa19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 ITSN1Q15811 1721 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 HMMRO75330 724 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 SBNO1A3KN83 1393 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRCP08575 1304 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 GNAI2P04899 355 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 LGR6Q9HBX8 967 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CRB1P82279 1406 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 C3P01024 1663 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 KCNQ3O43525 872 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 RGS12O14924 1447 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 FAM184AQ8NB25 1140 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 PEAK1Q9H792 1746 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK4Q16566 473 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ATP10DQ9P241 1426 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF4Q96M43 638 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 PTGS1P23219 599 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC183Q5T5S1 534 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 USP31Q70CQ4 1352 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0232Q92628 1395 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 PDE1AP54750 535 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF10O15013 1369 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ORAI2Q96SN7 254 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 KDM4AO75164 1064 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 BRD1O95696 1058 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms