RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 SEC24BO95487 1268 aa23.61■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 KSR2Q6VAB6 950 aa23.61■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 ATP8B2P98198 1209 aa23.61■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.6■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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USP39-202ENST00000409025 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.59■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.59■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 USP35Q9P2H5 1018 aa23.59■■□□□ 1.37
USP39-202ENST00000409025 PHLPP1O60346 1717 aa23.58■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 ALDH1L1O75891 902 aa23.57■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.55■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.55■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 USP16Q9Y5T5 823 aa23.55■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 APBB1O00213 710 aa23.54■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 MYL6BP14649 208 aa23.54■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.54■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 TOM1O60784 492 aa23.53■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.52■■□□□ 1.36
USP39-202ENST00000409025 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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USP39-202ENST00000409025 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.51■■□□□ 1.35
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USP39-202ENST00000409025 PAPPAQ13219 1627 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 SSH3Q8TE77 659 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 BCL11AQ9H165 835 aa23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 DISP2A7MBM2 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 COPS6Q7L5N1 327 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 ERBB4Q15303 1308 aa23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.48■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 POLA2Q14181 598 aa23.48■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 TTC22Q5TAA0 569 aa23.48■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.48■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.48■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.47■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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USP39-202ENST00000409025 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.47■■□□□ 1.35
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USP39-202ENST00000409025 SRGAP3O43295 1099 aa23.45■■□□□ 1.35
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USP39-202ENST00000409025 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
USP39-202ENST00000409025 UTYO14607 1347 aa23.44■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 GRM8O00222 908 aa23.44■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 RAB11FIP3O75154 756 aa23.44■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.44■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 EXOC5O00471 708 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 CDC45O75419 566 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 MTX1Q13505 466 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 IGKV5-2P06315 115 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.43■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 MYD88Q99836 296 aa23.42■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NRAPQ86VF7 1730 aa23.42■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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USP39-202ENST00000409025 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 PDE1AP54750 535 aa23.4■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.4■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NBPF26B4DH59 902 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NBPF14Q5TI25 921 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 NBPF15Q8N660 670 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 PIGBQ92521 554 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 ITGB4P16144 1822 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 LRP6O75581 1613 aa23.39■■□□□ 1.34
USP39-202ENST00000409025 GCKRQ14397 625 aa23.39■■□□□ 1.33
USP39-202ENST00000409025 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.38■■□□□ 1.33
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