RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 MBIPQ9NS73 344 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 PAF1Q8N7H5 531 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 FANCAO15360 1455 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK4Q16566 473 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 SKAP1Q86WV1 359 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC5O00471 708 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 IQCEQ6IPM2 695 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 IL27Q8NEV9 243 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ACEP12821 1306 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R4Q99570 1358 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE5O15320 804 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 NEFHP12036 1026 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 RAB34Q9BZG1 259 aa23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83GA6ND36 823 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS2O95450 1211 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 GPTP24298 496 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SSFA2P28290 1259 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1328Q86T90 577 aa23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLF2Q8IX21 1173 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN4Q92575 508 aa23.58■■□□□ 1.37
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY1B3Q02153 619 aa23.58■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TAF4BQ92750 862 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 GOLIM4O00461 696 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRHP07919 91 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TNIP1Q15025 636 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.56■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TTC22Q5TAA0 569 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN12O43309 604 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 LDHCP07864 332 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN14Q15678 1187 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 STX6O43752 255 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 NGLY1Q96IV0 654 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 IGHDP01880 384 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 USP16Q9Y5T5 823 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms