RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 USP25Q9UHP3 1055 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 FIBPO43427 364 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 MCM2P49736 904 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ATP8B2P98198 1209 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SPG7Q9UQ90 795 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 DIP2BQ9P265 1576 aa14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 TEFQ10587 303 aa14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CUL4AQ13619 759 aa14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 HS1BP3Q53T59 392 aa14.52□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.52□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 TERF1P54274 439 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 USP44Q9H0E7 712 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 TBX22Q9Y458 520 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 A0A0G2JS52 829 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SRGAP3O43295 1099 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 VGLL3A8MV65 326 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 DMTNQ08495 405 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ORAI2Q96SN7 254 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 TCHHQ07283 1943 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 RASEFQ8IZ41 740 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ITSN1Q15811 1721 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 C3P01024 1663 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 AK2P54819 239 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ANAPC15P60006 121 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PEAK1Q9H792 1746 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 USP6P35125 1406 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PHF14O94880 888 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 IL17REQ8NFR9 667 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 HSPA4P34932 840 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 HOXC9P31274 260 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 LARGE1O95461 756 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ADCY5O95622 1261 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 FLT4P35916 1363 aa14.46□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 SYT1P21579 422 aa14.46□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.46□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 STAP2Q9UGK3 403 aa14.46□□□□□ -0.09
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGEF10O15013 1369 aa14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 STX6O43752 255 aa14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 RUFY3Q7L099 469 aa14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 LGR6Q9HBX8 967 aa14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 SGSM2O43147 1006 aa14.45□□□□□ -0.1
NLRC3-201ENST00000324659 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms