RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.37■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.36■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 USP16Q9Y5T5 823 aa28.36■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.36■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 KSR2Q6VAB6 950 aa28.35■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 ATP8B2P98198 1209 aa28.35■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.34■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 MYL6BP14649 208 aa28.34■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.34■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.33■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.32■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.31■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.3■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 PIP4K2BP78356 416 aa28.3■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 GLI3P10071 1580 aa28.29■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 PHLPP1O60346 1717 aa28.29■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS2O95450 1211 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 COPS6Q7L5N1 327 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1L1O75891 902 aa28.26■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 DISP2A7MBM2 1401 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 TOM1O60784 492 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 LINS1Q8NG48 757 aa28.24■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 SSH3Q8TE77 659 aa28.24■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 PAPPAQ13219 1627 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV5-2P06315 115 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 POLA2Q14181 598 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 TTC22Q5TAA0 569 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 SRGAP3O43295 1099 aa28.2■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.2■■■□□ 2.11
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 TNS2Q63HR2 1409 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A3P48751 1232 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF26B4DH59 902 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 GRM8O00222 908 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF14Q5TI25 921 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF15Q8N660 670 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 MYD88Q99836 296 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 PIGBQ92521 554 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 UTYO14607 1347 aa28.15■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.15■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC5O00471 708 aa28.15■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.15■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 A1BGP04217 495 aa28.14■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.14■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 ERBB4Q15303 1308 aa28.14■■■□□ 2.1
VSTM4-201ENST00000298454 PDE1AP54750 535 aa28.14■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 SUCLG2Q96I99 432 aa28.14■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 MTX1Q13505 466 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 CDC45O75419 566 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 KAZALD1Q96I82 304 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 GCKRQ14397 625 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 NRAPQ86VF7 1730 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 RAB11FIP3O75154 756 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 SDSP20132 328 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 ATG3Q9NT62 314 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms