RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 KSR2Q6VAB6 950 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 BECN1Q14457 450 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 SSH3Q8TE77 659 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 C5P01031 1676 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 CDC45O75419 566 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 CABP4P57796 275 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 POLA2Q14181 598 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC11-201ENST00000243082 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 ALDH1L1O75891 902 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 MYT1Q01538 1121 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 IL2RBP14784 551 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 PDE1AP54750 535 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 STRN4Q9NRL3 753 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 USP16Q9Y5T5 823 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 SDSP20132 328 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 EVA1CP58658 441 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 LINS1Q8NG48 757 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 SRGAP3O43295 1099 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 MYL6BP14649 208 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC11-201ENST00000243082 GLI3P10071 1580 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 RAB11FIP3O75154 756 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 MTX1Q13505 466 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 COPS6Q7L5N1 327 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 UTYO14607 1347 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 IGKV5-2P06315 115 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 MX1P20591 662 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 KIF2CQ99661 725 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 STAP2Q9UGK3 403 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 GRM8O00222 908 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 BTG4Q9NY30 223 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 KAZALD1Q96I82 304 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 SUCLG2Q96I99 432 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 USP35Q9P2H5 1018 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 CASC1Q6TDU7 716 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 SNX21Q969T3 373 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 AOX1Q06278 1338 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NFKBIBQ15653 356 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 MYD88Q99836 296 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 USP26Q9BXU7 913 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 PAPPAQ13219 1627 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 GCKRQ14397 625 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 ERBB4Q15303 1308 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF26B4DH59 902 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF14Q5TI25 921 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXC11-201ENST00000243082 NBPF15Q8N660 670 aa22.72■■□□□ 1.23
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