RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.19■■□□□ 1.3
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SIKE1-201ENST00000060969 SLC4A3P48751 1232 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 BTG4Q9NY30 223 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.17■■□□□ 1.3
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SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.17■■□□□ 1.3
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SIKE1-201ENST00000060969 SDSP20132 328 aa23.01■■□□□ 1.27
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SIKE1-201ENST00000060969 SALL3Q9BXA9 1300 aa23■■□□□ 1.27
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SIKE1-201ENST00000060969 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIKE1-201ENST00000060969 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 MTX1Q13505 466 aa22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 PIGBQ92521 554 aa22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 GCKRQ14397 625 aa22.96■■□□□ 1.27
SIKE1-201ENST00000060969 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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