RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 OARD1Q9Y530 152 aa22.24■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 NDUFS4O43181 175 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJB6O75190 326 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF224P0DH78 156 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 AHRP35869 848 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CALCOCO2Q13137 446 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD37Q7Z713 158 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GRHL3Q8TE85 626 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PELI2Q9HAT8 420 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GPAMQ9HCL2 828 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 LANCL2Q9NS86 450 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MAST4O15021 2626 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.23■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C1QAP02745 245 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 IL10P22301 178 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CASQ1P31415 396 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 AP2B1P63010 937 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ARG2P78540 354 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 REEP5Q00765 189 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 POU4F1Q01851 419 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C2orf54Q08AI8 447 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TSNQ15631 228 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 FAR1Q8WVX9 515 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.152e-10■□□□□ 8.9
PPP1CC-211ENST00000620030 POLEQ07864 2286 aa22.22■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DYTNA2CJ06 578 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 WIPF3A6NGB9 483 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ALOX12P18054 663 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 AGTR2P50052 363 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 HNMTP50135 292 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TNFSF10P50591 281 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 RHAGQ02094 409 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PEX11GQ96HA9 241 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 OR1F2PQ96R84 312 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DERL2Q9GZP9 239 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM159BA6NKW6 160 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CHST10O43529 356 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 B3GALT4O96024 378 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SERPIND1P05546 499 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GPX6P59796 221 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 RGS1Q08116 209 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 HYAL2Q12891 473 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 DEFB134Q4QY38 66 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SMIM10Q96HG1 83 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 EGFL8Q99944 293 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF32Q9H0A6 362 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 STMN3Q9NZ72 180 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 E2F3O00716 465 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 DDAH2O95865 285 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 WDPCPO95876 746 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GSTA2P09210 222 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GDF5P43026 501 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC6A12P48065 614 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC12A2P55011 1212 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms