RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 BMP10O95393 424 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 C2P06681 752 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM153BP0C7A2 387 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CRABP2P29373 138 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PHBP35232 272 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 XCR1P46094 333 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 HNMTP50135 292 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 HYAL2Q12891 473 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NAB1Q13506 487 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TUBB8Q3ZCM7 444 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM153CQ494X1 144 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 DEFB134Q4QY38 66 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ATG9BQ674R7 924 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 LANCL3Q6ZV70 420 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP112Q8N8E3 955 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PEX11GQ96HA9 241 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PELI2Q9HAT8 420 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF358Q9NW07 568 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZFP69BQ9UJL9 534 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PLAAQ9Y263 795 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CSAG2Q9Y5P2 127 aa13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 COL12A1Q99715 3063 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A096LPK6 155 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 MAP2K7O14733 419 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TUBB4AP04350 444 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 COX6A1P12074 109 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ACPPP15309 386 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 EPORP19235 508 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CDC16Q13042 620 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 MYBPC3Q14896 1274 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CCT6BQ92526 530 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ATOH8Q96SQ7 321 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 AIF1LQ9BQI0 150 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SARGQ9BW04 601 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TGIF2Q9GZN2 237 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 VN1R1Q9GZP7 353 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 VPS11Q9H270 941 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 RHBGQ9H310 441 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ACOT9Q9Y305 439 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa13.55□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 H0YIG0 161 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CLGNO14967 610 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 STK16O75716 305 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 IGHEP01854 428 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GNAZP19086 355 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CD22P20273 847 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 TYK2P29597 1187 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GGT5P36269 586 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CSRP3P50461 194 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 DOC2AQ14183 400 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 XKR6Q5GH73 641 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00696Q6ZRV3 163 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 RELL1Q8IUW5 271 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 Q8NA96 180 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PDPRQ8NCN5 879 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 STAG3L4Q8TBR4 150 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NT5CQ8TCD5 201 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC44A1Q8WWI5 657 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 PAFAH2Q99487 392 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 CD244Q9BZW8 370 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 NMRAL1Q9HBL8 299 aa13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A087X1B8 175 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms