RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA3P26006 1051 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PHBP35232 272 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 XCR1P46094 333 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GLRBP48167 497 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 AGTR2P50052 363 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC16Q13042 620 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MYBPC3Q14896 1274 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ISCA2Q86U28 154 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP112Q8N8E3 955 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NT5CQ8TCD5 201 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PAFAH2Q99487 392 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOXF2Q9BQY4 288 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MFRPQ9BY79 579 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TGIF2Q9GZN2 237 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF160Q9HCG1 818 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNE2Q9Y6J6 123 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YIG0 161 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KERAO60938 352 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT3HO75486 399 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP10O95393 424 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 C2P06681 752 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CD22P20273 847 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 HNF4AP41235 474 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MLLT10P55197 1068 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB134Q4QY38 66 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG9BQ674R7 924 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LANCL3Q6ZV70 420 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX31Q8N9S9 440 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX19Q8NA77 164 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 AIF1LQ9BQI0 150 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 VN1R1Q9GZP7 353 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL31Q9H511 634 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC11Q9NVH1 559 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT4Q9NZJ9 180 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MKL2Q9ULH7 1088 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CSAG2Q9Y5P2 127 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHEP01854 428 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 HEXBP07686 556 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MTHFD2P13995 350 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CRABP2P29373 138 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 AHRP35869 848 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GGT5P36269 586 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB8P50452 374 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 EMP2P54851 167 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PWP1Q13610 501 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFBP7Q16270 282 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SULT1C3Q6IMI6 304 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8NA96 180 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX11GQ96HA9 241 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A096LPK6 155 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IPO13O94829 963 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 HPP00738 406 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM153BP0C7A2 387 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ALOX12P18054 663 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAZP19086 355 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA12P43365 314 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX8P57073 446 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB8AP61006 207 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS1Q08116 209 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PCOLCEQ15113 449 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PDK4Q16654 411 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM153CQ494X1 144 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms