RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CPZQ66K79 652 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GCNT7Q6ZNI0 430 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf64Q86WR6 236 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SIX5Q8N196 739 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT78Q8N1N4 520 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CBR4Q8N4T8 237 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01555Q8NAE3 123 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR156Q8NFN8 814 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NETO1Q8TDF5 533 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf78Q8WTQ4 265 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FIG4Q92562 907 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TFAP2CQ92754 450 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DNASE1L2Q92874 299 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF145Q96MT1 663 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PANX1Q96RD7 426 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPHS2Q99611 448 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51B5Q9H339 312 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MYNNQ9NPC7 610 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 EVPLLA8MZ36 301 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PDLIM1O00151 329 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PLOD2O00469 737 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBX19O60806 448 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNK5O95279 499 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FURINP09958 794 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM18P0DKX4 95 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCR2P25025 360 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PKLRP30613 574 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINB1P30740 379 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 HPCAL1P37235 193 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CCR8P51685 355 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NUBP1P53384 320 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PHEXP78562 749 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TDGQ13569 410 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GK3PQ14409 553 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CLCA4Q14CN2 919 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ADRM1Q16186 407 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MPEG1Q2M385 716 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM69Q86WT6 500 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PTOV1Q86YD1 416 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2L8Q8NGY9 312 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MTERF3Q96E29 417 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MRGPRX1Q96LB2 322 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf66Q96MD2 445 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 AIF1LQ9BQI0 150 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 BDH2Q9BUT1 245 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MS4A8Q9BY19 250 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM4Q9C037 500 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CHST8Q9H2A9 424 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MVB12BQ9H7P6 319 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNK12Q9HB15 430 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TAC3Q9UHF0 121 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms