RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CYTH2	Q99418	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	WDR47	O94967	919 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CELA2A	P08217	269 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CD1D	P15813	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ALOX12	P18054	663 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	STX2	P32856	288 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AHR	P35869	848 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLC6A12	P48065	614 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GLRB	P48167	497 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RAB10	P61026	200 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RGS1	Q08116	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	MFAP5	Q13361	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TGFBI	Q15582	683 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OR4D1	Q15615	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PSMF1	Q92530	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	LMF1	Q96S06	567 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.18	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TAPBP	O15533	448 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	DNAJB6	O75190	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	WFS1	O76024	890 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	B3GALT4	O96024	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CYC1	P08574	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ICAM2	P13598	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	GNAZ	P19086	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	IL10	P22301	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SOX11	P35716	441 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	HNF4A	P41235	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RAB8A	P61006	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	OLR1	P78380	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLMAP	Q14BN4	828 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	URAD	A6NGE7	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
THBS3-208	ENST00000496332	CHST10	O43529	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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