RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491490.5

RHBDD1-213, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RHBDD1, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-213ENST00000491490 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 USP7Q93009 1102 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 WDR34Q96EX3 536 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 KLHL31Q9H511 634 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PDE7BQ9NP56 450 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.39□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 C4orf51C9J302 202 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 FCHO1O14526 889 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TNFSF14O43557 240 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PCDH7O60245 1069 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 THRAP10827 490 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CD46P15529 392 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PNLIPP16233 465 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 LBPP18428 481 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 IL1RNP18510 177 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ACP1P24666 158 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 HRH2P25021 359 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CERS1P27544 350 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CASP2P42575 452 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 DIO3P55073 304 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 INHBCP55103 352 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 STX1BP61266 288 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 HSD11B2P80365 405 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RGS1Q08116 209 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 SLC14A1Q13336 389 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TUBB3Q13509 450 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PTGR1Q14914 329 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 NAA25Q14CX7 972 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RPS6KA2Q15349 733 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TERF2Q15554 542 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 Q6ZSR9 355 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RNF44Q7L0R7 432 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 LIX1Q8N485 282 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 OR8K5Q8NH50 307 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ERP27Q96DN0 273 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TCTN2Q96GX1 697 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 TSSK3Q96PN8 268 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CD180Q99467 661 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CDC6Q99741 560 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CTRCQ99895 268 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CENPKQ9BS16 269 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 MS4A8Q9BY19 250 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 KCNH6Q9H252 994 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RHBGQ9H310 441 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 C1orf109Q9NX04 203 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 EFCAB7A8K855 629 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 NR5A2O00482 541 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 PLPP1O14494 284 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 UBDO15205 165 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 AKAP10O43572 662 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 CBFA2T3O75081 653 aa7.37□□□□□ -1.23
RHBDD1-213ENST00000491490 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms