RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 NCF4Q15080 339 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CT83Q5H943 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SARM1Q6SZW1 724 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CNGA4Q8IV77 575 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TC2NQ8N9U0 490 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ACTL9Q8TC94 416 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HAUS1Q96CS2 278 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C19orf60Q96EN9 201 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA13Q96N96 652 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GBP5Q96PP8 586 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR2A14Q96R47 310 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 APOL2Q9BQE5 337 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM60AQ9NP50 221 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX7Q9UNH6 387 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TFR2Q9UP52 801 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ICKQ9UPZ9 632 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf74A8MZ97 194 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 E7EQ34 232 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CCL22O00626 93 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PJA2O43164 708 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AP2A2O94973 939 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LDLRP01130 860 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TPM1P09493 284 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS56P0CW18 603 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CBSLP0DN79 551 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RBP3P10745 1247 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PVRP15151 417 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HK1P19367 917 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGALP20701 1170 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP2A7P20853 494 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CBSP35520 551 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LGALS4P56470 323 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKG2Q13237 762 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP1A4Q13733 1029 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FHL2Q14192 279 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT33BQ14525 404 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PDCD1Q15116 288 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PARP6Q2NL67 630 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPESP1Q6UW49 350 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 STYXQ8WUJ0 223 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NACC2Q96BF6 587 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IP6K3Q96PC2 410 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RANBP9Q96S59 729 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MNTQ99583 582 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 XKR8Q9H6D3 395 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FANCEQ9HB96 536 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR83Q9NYM4 423 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms