RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454859.7

ECHDC1-210, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-210ENST00000454859 PRR23AA6NEV1 266 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 RFXANKO14593 260 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 EPN2O95208 641 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 VIPP01282 170 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 THEGLP0DJG4 465 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CTSEP14091 401 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 COX7A2P14406 83 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ACTR1BP42025 376 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 GSK3BP49841 420 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 NEK2P51955 445 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 EMP3P54852 163 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 POLE2P56282 527 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ACTR1AP61163 376 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 LIPEQ05469 1076 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 RGS1Q08116 209 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CYP4F3Q08477 520 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 BIRC2Q13490 618 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PTGR1Q14914 329 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 TEAD4Q15561 434 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ANO7Q6IWH7 933 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PAQR7Q86WK9 346 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 DEFB123Q8N688 67 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 VPS33AQ96AX1 596 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PDXPQ96GD0 296 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 TEX37Q96LM6 180 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 KCNC2Q96PR1 638 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CD180Q99467 661 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 DUSP26Q9BV47 211 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 GPR174Q9BXC1 333 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SERHLQ9NQF3 203 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CA14Q9ULX7 337 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 VPS4AQ9UN37 437 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 AP4S1Q9Y587 144 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 OR2A25A4D2G3 310 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ANTXRLA6NF34 631 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 A8MUI8 341 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 AXIN1O15169 862 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 DPM1O60762 260 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 GPR37L1O60883 481 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SCN2BO60939 215 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 KRT36O76013 467 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 PDE5AO76074 875 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ANP32DO95626 131 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 KRT75O95678 551 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 FURINP09958 794 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 BMP2P12643 396 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 IL9P15248 144 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 GGT1P19440 569 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 DDCP20711 480 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CCT8P50990 548 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 KLC1Q07866 573 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 UGT8Q16880 541 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CPZQ66K79 652 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 Q6ZS52 159 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 NRROSQ86YC3 692 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 OR2L5Q8NG80 312 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 OR13H1Q8NG92 308 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-210ENST00000454859 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms