RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ABI3Q9P2A4 366 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 VWA7Q9Y334 891 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YVX5 310 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 TLDC2A0PJX2 215 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 FITM1A5D6W6 292 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 FAM159BA6NKW6 160 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 NRP2O60462 931 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ALOX12BO75342 701 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 WFS1O76024 890 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 UNC5CO95185 931 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 RASAL1O95294 804 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 BMP10O95393 424 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA7P05543 415 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 C8GP07360 202 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CTSBP07858 339 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2ADP20671 130 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CAPN3P20807 821 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B2P37059 387 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CA7P43166 264 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 SLCO1A2P46721 670 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 TDGF1P3P51864 188 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 KCNK10P57789 538 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZNF844Q08AG5 666 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MUM1Q2TAK8 710 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZNF480Q8WV37 535 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MVB12AQ96EY5 273 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CCDC120Q96HB5 630 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CYTH2Q99418 400 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 DPH7Q9BTV6 452 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 RNF32Q9H0A6 362 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CTSFQ9UBX1 484 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 C3orf18Q9UK00 162 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPV9 198 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HYKKA2RU49 373 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 GFYI3L273 518 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 KLHL18O94889 574 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CCNDBP1O95273 360 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 C1QAP02745 245 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 PRR35P0CG20 571 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 IMPA1P29218 277 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 MSH2P43246 934 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 OR1D4P47884 311 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 TBPL1P62380 186 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 KLC1Q07866 573 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 SP140Q13342 867 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 KRT71Q3SY84 523 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 COX15Q7KZN9 410 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 EID3Q8N140 333 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 VPS39Q96JC1 886 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 PAFAH2Q99487 392 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 RHOJQ9H4E5 214 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 PARVBQ9HBI1 364 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 GPAMQ9HCL2 828 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-210ENST00000442481 PDE10AQ9Y233 779 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms