RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423742.1

AFG3L1P-207, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L1P, Length 1,012 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-207ENST00000423742 REEP5Q00765 189 aa21.53■■□□□ 1.04
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AFG3L1P-207ENST00000423742 GPSM1Q86YR5 675 aa21.53■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 GALNT11Q8NCW6 608 aa21.53■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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AFG3L1P-207ENST00000423742 GNAZP19086 355 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 UQCRFS1P47985 274 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 ATP6V0D1P61421 351 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.044e-7■■■■□ 19.9
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AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM205Q6UW68 189 aa21.52■■□□□ 1.04
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AFG3L1P-207ENST00000423742 Q6ZS92 163 aa21.52■■□□□ 1.04
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AFG3L1P-207ENST00000423742 PEX11GQ96HA9 241 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 CNDP1Q96KN2 507 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 CYTH2Q99418 400 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF700Q9H0M5 742 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 WWOXQ9NZC7 414 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 CSAG2Q9Y5P2 127 aa21.52■■□□□ 1.04
AFG3L1P-207ENST00000423742 SHANK1Q9Y566 2161 aa21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 OR2W5A6NFC9 320 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 SERPINA7P05543 415 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 ALOX12P18054 663 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 GNLYP22749 145 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 HNF4AP41235 474 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC6A12P48065 614 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 SKP1P63208 163 aa21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 PCOLCEQ15113 449 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 OR4D1Q15615 310 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 IGFL2Q6UWQ7 119 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 LANCL3Q6ZV70 420 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 ABHD13Q7L211 337 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 CUZD1Q86UP6 607 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.51■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 CD274Q9NZQ7 290 aa21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 RNF112Q9ULX5 631 aa21.51■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 CDC16Q13042 620 aa21.5■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 SIRT6Q8N6T7 355 aa21.5■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 TAPBPO15533 448 aa21.49■■□□□ 1.03
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AFG3L1P-207ENST00000423742 RAB8AP61006 207 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 OLR1P78380 273 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 CRB2Q5IJ48 1285 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-207ENST00000423742 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.49■■□□□ 1.03
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