RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PSD4Q8NDX1 1056 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR8J2Q8NGG1 315 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MCFD2Q8NI22 146 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NFKBIDQ8NI38 313 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 WDR48Q8TAF3 677 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF558Q96NG5 402 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PKP4Q99569 1192 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NRTNQ99748 197 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CORO1BQ9BR76 489 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC46A2Q9BY10 475 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ROGDIQ9GZN7 287 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DCSTAMPQ9H295 470 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FAM83DQ9H4H8 585 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ABCB10Q9NRK6 738 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GPATCH2Q9NW75 528 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GPR83Q9NYM4 423 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 CCL16O15467 120 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TGM5O43548 720 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LEFTY1O75610 366 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJB5O75953 348 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf47O95873 294 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TGFB1P01137 390 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 STSP08842 583 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IDSP22304 550 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SEPHS1P49903 392 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CXCR4P61073 352 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HBA1P69905 142 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SP140Q13342 867 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TP53BP2Q13625 1128 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DOC2BQ14184 412 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 PROX2Q3B8N5 592 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ARSIQ5FYB1 569 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CDKL4Q5MAI5 379 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LIPJQ5W064 366 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM215Q68D42 235 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GRHL2Q6ISB3 625 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ERICH5Q6P6B1 374 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 P3H2Q8IVL5 708 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FAM9CQ8IZT9 166 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PGBD3Q8N328 593 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SVOPQ8N4V2 548 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TCEAL4Q96EI5 215 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DACH2Q96NX9 599 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PITX2Q99697 317 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ITPAQ9BY32 194 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 OR51E2Q9H255 320 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00597Q9H2U6 94 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPNS1Q9H2V7 528 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DSN1Q9H410 356 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ITM2CQ9NQX7 267 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HS3ST2Q9Y278 367 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM17Q9Y577 477 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MGAT4DA6NG13 374 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM221A6NGB7 291 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 A8MU76 341 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 AQP9O43315 295 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TBX1O43435 398 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 AIREO43918 545 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MYO1DO94832 1006 aa6.99□□□□□ -1.29
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