RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa19.57■□□□□ 0.72
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UBE2B-201ENST00000265339 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF678Q5SXM1 525 aa19.54■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa19.54■□□□□ 0.72
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