RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	WFS1	O76024	890 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	WISP2	O76076	250 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	WDR47	O94967	919 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	FKBP9	O95302	570 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	BMP10	O95393	424 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ONECUT2	O95948	504 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	HP	P00738	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CD63	P08962	238 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	PRR35	P0CG20	571 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	GRK3	P35626	688 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CCR8	P51685	355 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	GPX6	P59796	221 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	BTG2	P78543	158 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	PMP22	Q01453	160 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CALCOCO2	Q13137	446 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SP140	Q13342	867 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	BMPR2	Q13873	1038 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ATG9B	Q674R7	924 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	LCTL	Q6UWM7	567 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SBSN	Q6UWP8	590 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498		Q6ZS92	163 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CYP4X1	Q8N118	509 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SNX31	Q8N9S9	440 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	OR56A3	Q8NH54	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	GRHL3	Q8TE85	626 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	TM9SF4	Q92544	642 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NEIL2	Q969S2	332 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	VPS39	Q96JC1	886 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	IP6K3	Q96PC2	410 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ERP44	Q9BS26	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NAT9	Q9BTE0	207 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NBAS	A2RRP1	2371 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	C2orf72	A6NCS6	295 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	FAM187A	A6NFU0	413 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	TAPBP	O15533	448 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55	6e-9	■■■□□ 15.8
HCG18-243	ENST00000602498	CHST10	O43529	356 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CBX6	O95503	412 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	WDPCP	O95876	746 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	IGHE	P01854	428 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	CCDC166	P0CW27	439 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	MAOA	P21397	527 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SCTR	P47872	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	HSPA7	P48741	367 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	KCNK10	P57789	538 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	BTN3A2	P78410	334 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	REEP5	Q00765	189 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	IRF9	Q00978	393 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF33B	Q06732	778 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	RGS1	Q08116	209 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
HCG18-243	ENST00000602498	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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