RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MR1	Q95460	341 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C21orf140	B9A014	251 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	COPE	O14579	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CLGN	O14967	610 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	OR1F1	O43749	312 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EPB42	P16452	691 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GRK3	P35626	688 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DLST	P36957	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PRKAA2	P54646	552 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HERVK_113	P63132	956 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CYP4F2	P78329	520 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	IRF8	Q02556	426 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CASP8	Q14790	479 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLC9A5	Q14940	896 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MUM1	Q2TAK8	710 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AMER3	Q8N944	861 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PGM2	Q96G03	612 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RHBG	Q9H310	441 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZNF225	Q9UK10	706 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538		K7ENP7	123 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	AGPS	O00116	658 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PPP6C	O00743	305 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NDUFS4	O43181	175 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	UGDH	O60701	494 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SPAG7	O75391	227 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	GSTM2	P28161	218 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ETV4	P43268	484 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FOXL2	P58012	376 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PWP1	Q13610	501 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	IL10RA	Q13651	578 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FAM53B	Q14153	422 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	STARD8	Q92502	1023 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SMIM10	Q96HG1	83 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SPSB2	Q99619	263 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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