RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569342.5

BBS2-220, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5

Gene BBS2, Length 1,525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-220ENST00000569342 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 NCF4Q15080 339 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 XKR6Q5GH73 641 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 COX15Q7KZN9 410 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CNPY4Q8N129 248 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TCFL5Q9UL49 500 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PLAAQ9Y263 795 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SCN2AQ99250 2005 aa15.95■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CHD6Q8TD26 2715 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 NDUFS4O43181 175 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SMIM24O75264 130 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ONECUT2O95948 504 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 EPB42P16452 691 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 AHRP35869 848 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 IRF8Q02556 426 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CHIT1Q13231 466 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 WFS1O76024 890 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GSTA1P08263 222 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CXCR2P25025 360 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CDC20Q12834 499 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 FAM53BQ14153 422 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 NDUFA9Q16795 377 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 LCA5Q86VQ0 697 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 KRT78Q8N1N4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 COL26A1Q96A83 441 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 WDR34Q96EX3 536 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 DRC3Q9H069 523 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 EHD1Q9H4M9 534 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 MED13Q9UHV7 2174 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 A8MT66 165 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 E2F3O00716 465 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 FFAR3O14843 346 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GPR42O15529 346 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 IL1RNP18510 177 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 KRT4P19013 534 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CASP2P42575 452 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 MC1RQ01726 317 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PWP1Q13610 501 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 IL10RAQ13651 578 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GTF2H2Q13888 395 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 E2F2Q14209 437 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SYVN1Q86TM6 617 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 SHISA5Q8N114 240 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TRPV3Q8NET8 790 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 NT5CQ8TCD5 201 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 MVB12AQ96EY5 273 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 COPG2Q9UBF2 871 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CTSFQ9UBX1 484 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 EMCNQ9ULC0 261 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TMCO1Q9UM00 188 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.93■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 CDC14CA4D256 554 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 STX16O14662 325 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 B3GALT4O96024 378 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 ALBP02768 609 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 HNF4AP41235 474 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 PCDH1Q08174 1060 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 HYAL2Q12891 473 aa15.92■□□□□ 0.14
BBS2-220ENST00000569342 TBCCQ15814 346 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms