RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NAB1	Q13506	487 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PWP1	Q13610	501 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784		Q8NA96	180 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	EGFL8	Q99944	293 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	LHPP	Q9H008	270 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	OR1F1	O43749	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TUBB4A	P04350	444 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IL1RN	P18510	177 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SCTR	P47872	440 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SLC6A12	P48065	614 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RAB10	P61026	200 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SKP1	P63208	163 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	REEP5	Q00765	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784		Q0VFX4	171 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	HERC3	Q15034	1050 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TGFBI	Q15582	683 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NT5C	Q8TCD5	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SGK494	L7N484	410 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NDUFS4	O43181	175 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CD1D	P15813	335 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IL10	P22301	178 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	XCR1	P46094	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RGS1	Q08116	209 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784		Q6ZS92	163 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RDH16	O75452	317 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	FAM155B	O75949	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL18	O94889	574 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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