RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	BIRC2	Q13490	618 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	STPG1	Q5TH74	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	METTL4	Q8N3J2	472 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MOCOS	Q96EN8	888 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	QRFPR	Q96P65	431 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MAP3K3	Q99759	626 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ACPT	Q9BZG2	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PDE7B	Q9NP56	450 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	C1orf109	Q9NX04	203 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	AHSP	Q9NZD4	102 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	USP34	Q70CQ2	3546 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379		B4E171	279 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	NDUFAB1	O14561	156 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ANKRD28	O15084	1053 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MAP3K7	O43318	606 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	DCTN3	O75935	186 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PDYN	P01213	254 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CYC1	P08574	325 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IFI6	P09912	130 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PRPS2	P11908	318 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CEACAM1	P13688	526 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IDO1	P14902	403 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ST6GAL1	P15907	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TSPAN8	P19075	237 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CDH3	P22223	829 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MAPK1	P28482	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ALDH4A1	P30038	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	BCL6	P41182	706 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TSPAN7	P41732	249 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ARFIP2	P53365	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	OR1D5	P58170	312 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	SKP1	P63208	163 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	DAB2	P98082	770 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ACY1	Q03154	408 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TGM3	Q08188	693 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IL11RA	Q14626	422 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	NATD1	Q8N6N6	113 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	OR2L5	Q8NG80	312 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	OR2T11	Q8NH01	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF41-208	ENST00000550379	IFI44	Q8TCB0	444 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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