RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OARD1	Q9Y530	152 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PQ72	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	URAD	A6NGE7	173 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SGK494	L7N484	410 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC7	O00311	574 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINA7	P05543	415 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR35	P0CG20	571 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	STMN1	P16949	149 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	IL10	P22301	178 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	XCR1	P46094	333 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PLTP	P55058	493 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MFAP5	Q13361	173 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TLR1	Q15399	786 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	LMF1	Q96S06	567 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SARG	Q9BW04	601 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RDH16	O75452	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHL18	O94889	574 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR47	O94967	919 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	AGFG2	O95081	481 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GNAZ	P19086	355 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	STX2	P32856	288 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	AHR	P35869	848 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GP5	P40197	560 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	AGTR2	P50052	363 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ARG2	P78540	354 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393		Q0VFX4	171 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC16	Q13042	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CYS1	Q717R9	158 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CEP97	Q8IW35	865 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RBBP8	Q99708	897 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	JRK	O75564	520 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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