RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ALG9Q9H6U8 611 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PELI2Q9HAT8 420 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NFU1Q9UMS0 254 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PRAMEF4O60810 478 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ALOX12BO75342 701 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 C2P06681 752 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 IL1RNP18510 177 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TFEBP19484 476 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 IRF9Q00978 393 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 RAPSNQ13702 412 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PDPRQ8NCN5 879 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NXNL1Q96CM4 212 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SNX15Q9NRS6 342 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 C3orf18Q9UK00 162 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ASB1Q9Y576 335 aa14.93□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 H0YIG0 161 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SGK494L7N484 410 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NDUFS4O43181 175 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AVPR1BP47901 424 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 HSPA7P48741 367 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PGDP52209 483 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 RBBP7Q16576 425 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ATG9BQ674R7 924 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 GALNT16Q8N428 558 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 EXT2Q93063 718 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 C8orf44Q96CB5 159 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 WWOXQ9NZC7 414 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CD274Q9NZQ7 290 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 RNF112Q9ULX5 631 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 ACOT9Q9Y305 439 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NBASA2RRP1 2371 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.92□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 IDSB3KWA1 339 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 J3QKU1 62 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 KERAO60938 352 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 DNAJB6O75190 326 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 JRKO75564 520 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 BMP10O95393 424 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 B3GALT4O96024 378 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 IGHEP01854 428 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SERPIND1P05546 499 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 GNAZP19086 355 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 EPORP19235 508 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AHRP35869 848 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AGTR2P50052 363 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 EMP2P54851 167 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SOX8P57073 446 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 HYAL2Q12891 473 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 KLRB1Q12918 225 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CDC16Q13042 620 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 PWP1Q13610 501 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 IFT20Q8IY31 132 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 NT5CQ8TCD5 201 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 GPR78Q96P69 363 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 TRIM4Q9C037 500 aa14.91□□□□□ -0.02
SERF1B-208ENST00000515588 AICDAQ9GZX7 198 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.4 ms