RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TAAR6Q96RI8 345 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 LMF1Q96S06 567 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OR2W5A6NFC9 320 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 H7BY64 318 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PFDN6O15212 129 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZG16O60844 167 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 C1QAP02745 245 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 EDN3P14138 238 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PAMP19021 973 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 IMPA1P29218 277 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 EMP3P54852 163 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 KCNK10P57789 538 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MPP1Q00013 466 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLC29A2Q14542 456 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CASP8Q14790 479 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NAA25Q14CX7 972 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PCOLCEQ15113 449 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.493e-8■■■□□ 17.3
PRAME-212ENST00000485532 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CD200R1Q8TD46 325 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 VPS50Q96JG6 964 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 GPR21Q99679 349 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FUT8Q9BYC5 575 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 DRC3Q9H069 523 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OLAHQ9NV23 265 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF446Q9NWS9 450 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SCN2AQ99250 2005 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CREBBPQ92793 2442 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 GFYI3L273 518 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 WISP2O76076 250 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 HAUS5O94927 633 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CCNDBP1O95273 360 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 WDPCPO95876 746 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SHBGP04278 402 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SERPINA7P05543 415 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ANXA5P08758 320 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MPC1LP0DKB6 136 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CXCR2P25025 360 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TDGF1P3P51864 188 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NEK10Q6ZWH5 1172 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FJX1Q86VR8 437 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FBF1Q8TES7 1133 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MVB12AQ96EY5 273 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CCDC138Q96M89 665 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 DHRS7Q9Y394 339 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQ72 361 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 FEZF1A0PJY2 475 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 DYTNA2CJ06 578 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 WFS1O76024 890 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 BMP10O95393 424 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 NUDT17P0C025 328 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 STX2P32856 288 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PHBP35232 272 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B2P37059 387 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF10P50591 281 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PGGT1BP53609 377 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 LONRF1Q17RB8 773 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms