RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480205.5

PSMD6-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-208	ENST00000480205	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NR4A3	Q92570	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LIME1	Q9H400	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ANK2	Q01484	3957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PSMA7	O14818	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC4A1	P02730	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC2A4	P14672	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CHRNB2	P17787	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MMP8	P22894	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CD151	P48509	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PTH2R	P49190	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LMAN1	P49257	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	GSDMD	P57764	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SNX16	P57768	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	C21orf58	P58505	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	KRT85	P78386	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	INSC	Q1MX18	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ARC	Q7LC44	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CPT1B	Q92523	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	EID2B	Q96D98	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CUBN	O60494	3623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205		A0A0J9YYE9	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205		C9J4A7	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PEX12	O00623	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CHUK	O15111	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF749	O43361	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	COQ9	O75208	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MTA2	O94776	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CLDN14	O95500	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TRBC1	P01850	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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