RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 F11P03951 625 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 FAM189BP81408 668 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ADGRF1Q5T601 910 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ANKRD46Q86W74 232 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ULK4Q96C45 1275 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF382Q96SR6 550 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TIGARQ9NQ88 270 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC182A6NF36 153 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CA12O43570 354 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CLDN7O95471 211 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 PTGER3P43115 390 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 RGS6P49758 472 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 NPRL3Q12980 569 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 IDO2Q6ZQW0 420 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SCLYQ96I15 445 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SLC22A12Q96S37 553 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 DYRK4Q9NR20 520 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ELOVL2Q9NXB9 296 aa18.5■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 B3GALT4O96024 378 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 PTHP01270 115 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ESR1P03372 595 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 STSP08842 583 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ALG1LQ6GMV1 187 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 FLCNQ8NFG4 579 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CFL2Q9Y281 166 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 A0A1W2PQ09 198 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 FPR1P21462 350 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 NUDT1P36639 197 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 RPS5P46782 204 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CDH18Q13634 790 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 EFR3AQ14156 821 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 KIAA0040Q15053 153 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SBSNQ6UWP8 590 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 DEDD2Q8WXF8 326 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 UCK2Q9BZX2 261 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 GPR83Q9NYM4 423 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 IL17CQ9P0M4 197 aa18.49■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 INPPL1O15357 1258 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ADORA3P0DMS8 318 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CSKP41240 450 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 FAPQ12884 760 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 GALNT10Q86SR1 603 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 STX19Q8N4C7 294 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ZFAND1Q8TCF1 268 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 DPY30Q9C005 99 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CSF2P04141 144 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SLC10A3P09131 477 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 LIX1Q8N485 282 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 GGHQ92820 318 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SMURF1Q9HCE7 757 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 DHRS7Q9Y394 339 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 KLK8O60259 260 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 LRATO95237 230 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 PGRP06401 933 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CDK1P06493 297 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 MYL9P24844 172 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ERP29P30040 261 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CACNG1Q06432 222 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ESX1Q8N693 406 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 GPR151Q8TDV0 419 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 KCNC2Q96PR1 638 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 OR52E6Q96RD3 313 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SIRT5Q9NXA8 310 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 EFCAB10A6NFE3 127 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 H7C4K7 107 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 AKR7A2O43488 359 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 SCO1O75880 301 aa18.47■□□□□ 0.55
TRPC1-203ENST00000476941 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms