RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 COPG2Q9UBF2 871 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 OPTCQ9UBM4 332 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TCFL5Q9UL49 500 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TMCO1Q9UM00 188 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TLDC2A0PJX2 215 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 C9J4A7 227 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TK2O00142 265 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ALBP02768 609 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 GSTA1P08263 222 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CD63P08962 238 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 FURINP09958 794 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CD22P20273 847 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CXCR2P25025 360 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PWP1Q13610 501 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 DOC2AQ14183 400 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ERV3-1Q14264 604 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC9A5Q14940 896 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TBCCQ15814 346 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 C16orf46Q6P387 395 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SYVN1Q86TM6 617 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TEX9Q8N6V9 391 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 NT5CQ8TCD5 201 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 FKBP10Q96AY3 582 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-208ENST00000464263 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 E2F3O00716 465 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 STX16O14662 325 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SMIM24O75264 130 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PRKAR1AP10644 381 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 EPB42P16452 691 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 KRT15P19012 456 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 IRF8Q02556 426 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CDC20Q12834 499 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 HYAL2Q12891 473 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 CHIT1Q13231 466 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 NDUFA9Q16795 377 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 XKR6Q5GH73 641 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 KRT78Q8N1N4 520 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 AMER3Q8N944 861 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TRPV3Q8NET8 790 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PHF21BQ96EK2 531 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 DRC3Q9H069 523 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 NDUFS4O43181 175 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 FOXL2P58012 376 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 RHDQ02161 417 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC18A2Q05940 514 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 LAPTM5Q13571 262 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 IL10RAQ13651 578 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 GTF2H2Q13888 395 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 NKG7Q16617 165 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 UGT8Q16880 541 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 TTC9Q92623 222 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 COL26A1Q96A83 441 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SMIM10Q96HG1 83 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-208ENST00000464263 AICDAQ9GZX7 198 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms