RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TIFAQ96CG3 184 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A13Q96H72 371 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf74Q96LT6 269 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 POLE4Q9NR33 117 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KRT84Q9NSB2 600 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf109Q9NX04 203 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GBF1Q92538 1859 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 XPNPEP2O43895 674 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MPZL2O60487 215 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ECI2O75521 394 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PDE9AO76083 593 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-25P01717 112 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A1P02730 911 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GALTP07902 379 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HMBSP08397 361 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ARSAP15289 507 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CSF2RAP15509 400 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NR4A2P43354 598 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA11P43364 429 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KCNC1P48547 511 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEPHS1P49903 392 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RAB25P57735 213 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL2P60568 153 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FPGSQ05932 587 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MANEALQ5VSG8 457 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CES5AQ6NT32 575 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DET1Q7L5Y6 550 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SYVN1Q86TM6 617 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPSM1Q86YR5 675 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR4L1Q8NH43 312 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 METTL6Q8TCB7 284 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ITCHQ96J02 903 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 COL21A1Q96P44 957 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA7Q96RP8 456 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RAD9AQ99638 391 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 COPS4Q9BT78 406 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DPY30Q9C005 99 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IFT22Q9H7X7 185 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NUP205Q92621 2012 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 A0A096LPI6 279 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 A8MVJ9 347 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LDB2O43679 373 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS3O75489 264 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FGBP02675 491 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRKCAP17252 672 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LAG3P18627 525 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1AP35813 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3CGP48736 1102 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC11A1P49279 550 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TTPAP49638 278 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFV1P49821 464 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PIGFQ07326 219 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPR50Q13585 617 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TCTN1Q2MV58 587 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.95□□□□□ -1.3
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