RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACP1P24666 158 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT22Q9BRQ3 303 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf109Q9NX04 203 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM1O15116 133 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GP1BAP07359 652 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CFHR1Q03591 330 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZIC1Q15915 447 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHSY3Q70JA7 882 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA19Q7Z5L4 167 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC5Q8NAU1 212 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE7BQ9NP56 450 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPT2Q9UMR5 302 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL27Q9Y4X3 112 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBDO15205 165 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF10O60809 474 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBB3Q13509 450 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf136Q5SQH8 315 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF44Q7L0R7 432 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 VN1R5Q7Z5H4 357 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PILRAQ9UKJ1 303 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQM1 296 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFS4O43181 175 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK-8P63133 956 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS1Q08116 209 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS42Q7Z5A4 293 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASPGQ86U10 573 aa26.23■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC13A3Q8WWT9 602 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRL4Q96PJ5 515 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC37BQ96QE4 947 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51B5Q9H339 312 aa26.23■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM9Q9P0T7 183 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRYLO94915 3013 aa26.23■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP1GDS1P52306 607 aa26.22■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STPG1Q5TH74 334 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSM2BQ68CK6 577 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 OGFOD2Q6N063 350 aa26.22■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4D9Q8NGE8 314 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREB3L4Q8TEY5 395 aa26.22■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2A5Q96R48 311 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A8Q9BY19 250 aa26.22■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINA6P08185 405 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEPHS1P49903 392 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD11B2P80365 405 aa26.21■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa26.21■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EMX2Q04743 252 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 PWP1Q13610 501 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIDRQ14159 915 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS6KA2Q15349 733 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM35AQ53FP2 167 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIN4Q56A73 249 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.2■■□□□ 1.79
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