RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC66Q68CR7 880 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMKMTQ7Z624 323 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SCRN2Q96FV2 425 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 COL21A1Q96P44 957 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SNPHO15079 494 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SELENOWP63302 87 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZNB5 142 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 EFEMP2O95967 443 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPHS1P49903 392 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 IRF8Q02556 426 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 IRF3Q14653 427 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TEAD4Q15561 434 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A8Q8N695 610 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.35■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HAT1O14929 419 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ADORA3P0DMS8 318 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA8P13928 327 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 S100A5P33763 92 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMG2Q02383 582 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PTSQ03393 145 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ASIC4Q96FT7 647 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRR3A8MPY1 467 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DLGAP3O95886 979 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSM2AQ08AH3 577 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNC3Q14003 757 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSM2BQ68CK6 577 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 AMBNQ9NP70 447 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS4AQ9UN37 437 aa21.34■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 A8MVJ9 347 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TLL1O43897 1013 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SPNP16150 400 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ETV6P41212 452 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CPTPQ5TA50 214 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF180Q86T96 592 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 MAL2Q969L2 176 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CRELD1Q96HD1 420 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXD1Q9GZZ0 328 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD18Q9NS91 495 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR83Q9NYM4 423 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX16Q9Y5Y5 336 aa21.33■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT87PA6NCN2 255 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX4O95219 450 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 STSP08842 583 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 HSD3B1P14060 373 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 HSD3B2P26439 372 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 ASMTP46597 345 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 PCYT1AP49585 367 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 RGS6P49758 472 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZXDBP98169 803 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 GAB1Q13480 694 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF12Q16514 161 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 RFLNAQ6ZTI6 216 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 NAGSQ8N159 534 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 CHTF18Q8WVB6 975 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 BHMTQ93088 406 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ8BQ96D53 544 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A12Q96S37 553 aa21.33■■□□□ 1
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms