RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 TIMP2P16035 220 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF6Q15052 776 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NDNFQ8TB73 568 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 FOPNLQ96NB1 174 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PKP4Q99569 1192 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 LEFTY1O75610 366 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CTSAP10619 480 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 GRK3P35626 688 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PPM1AP35813 382 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 KRT20P35900 424 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PRMT2P55345 433 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TLE2Q04725 743 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ARSIQ5FYB1 569 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 LILRA6Q6PI73 481 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 HUS1BQ8NHY5 278 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 VWCEQ96DN2 955 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 HRASLS5Q96KN8 279 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RASSF1Q9NS23 344 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SLC5A10A0PJK1 596 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SLC16A8O95907 504 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 IMPA1P29218 277 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PREPP48147 710 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CRYBA2P53672 197 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PNLIPRP1P54315 467 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RELAQ04206 551 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NAGSQ8N159 534 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 OR4A15Q8NGL6 344 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 IRF7Q92985 503 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CXorf40BQ96DE9 158 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DEFB118Q96PH6 123 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 VPS35Q96QK1 796 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ZBP1Q9H171 429 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 WBP4O75554 376 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NTRK1P04629 796 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PORP16435 677 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 BDKRB1P46663 353 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 CTSCP53634 463 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 VBP1P61758 197 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SELENOWP63302 87 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DEFB103AP81534 67 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DGCR6Q14129 220 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TRIM16LQ309B1 348 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ADCK1Q86TW2 530 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 GLYATL1Q969I3 302 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 REPS1Q96D71 796 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TSPAN11A1L157 253 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ZNF197O14709 1029 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PCDHGA12O60330 932 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SH3BGRLO75368 114 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 IMPDH2P12268 514 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TYRP14679 529 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 XPAP23025 273 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RRM2P31350 389 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 PRLHRP49683 370 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 LSM3P62310 102 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 GAB1Q13480 694 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 MED27Q6P2C8 311 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 MAL2Q969L2 176 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 UBE2FQ969M7 185 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RHNO1Q9BSD3 238 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 EPS8L2Q9H6S3 715 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 FBXO8Q9NRD0 319 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ATP6V1HQ9UI12 483 aa19.99■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TOR1BO14657 336 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 NPC1O15118 1278 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 MYCP01106 439 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 RPS13P62277 151 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 FADDQ13158 208 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 E2F2Q14209 437 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 ADNP2Q6IQ32 1131 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa19.98■□□□□ 0.79
STRADB-201ENST00000194530 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms