RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-211	ENST00000589550	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550		M0R296	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CLDN3	O15551	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	GRAP2	O75791	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR6A2	O95222	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	GP1BB	P13224	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCKBR	P32239	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	MAGEA4	P43358	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC6A12	P48065	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	HAS2	Q92819	552 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	NDN	Q99608	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	TXN2	Q99757	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	RNF121	Q9H920	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A1W2PPI3	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PSMD3	O43242	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DIRAS3	O95661	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KRT6B	P04259	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CDH3	P22223	829 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CETN2	P41208	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KRT6C	P48668	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PCYT1A	P49585	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FKBP1B	P68106	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCZ1B	P86790	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DLG1	Q12959	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TAF10	Q12962	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GAGE5	Q13069	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GAGE6	Q13070	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CEBPE	Q15744	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	STH	Q8IWL8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SSX3	Q99909	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ASCL2	Q99929	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SYNGR3	O43761	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC28A2	O43868	658 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ACSL4	O60488	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CLN5	O75503	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PIGN	O95427	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	AK1	P00568	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SFTPB	P07988	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms