RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 FZD2Q14332 565 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 UGT8Q16880 541 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 RABL3Q5HYI8 236 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 WLSQ5T9L3 541 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 IYDQ6PHW0 289 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 GPR180Q86V85 440 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 DHFR2Q86XF0 187 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SIX5Q8N196 739 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 HIPK4Q8NE63 616 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 COQ8BQ96D53 544 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 EGLN2Q96KS0 407 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 NRTNQ99748 197 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SARGQ9BW04 601 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 FOXQ1Q9C009 403 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SERHLQ9NQF3 203 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MCM8Q9UJA3 840 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SNX7Q9UNH6 387 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 LRRC42Q9Y546 428 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TRBC2A0A5B9 178 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SCAMP1O15126 338 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 DFNA5O60443 496 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 NDUFS2O75306 463 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 CLEC3AO75596 197 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 KLHL18O94889 574 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 BAG2O95816 211 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 VHLP40337 213 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ARFIP1P53367 373 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 WNT3P56703 355 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ZIC1Q15915 447 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PGS1Q32NB8 556 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 LCN8Q6JVE9 175 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 IQCHQ86VS3 1027 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SPATA24Q86W54 205 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PROSER1Q86XN7 944 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 FRMD1Q8N878 549 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TTLQ8NG68 377 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 WDR48Q8TAF3 677 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 NRG4Q8WWG1 115 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 LCN9Q8WX39 176 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 RLN3Q8WXF3 142 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MTERF3Q96E29 417 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PPM1MQ96MI6 270 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 QRFPRQ96P65 431 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 IER2Q9BTL4 223 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 EBPLQ9BY08 206 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MS4A8Q9BY19 250 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TRIM15Q9C019 465 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 OR51B5Q9H339 312 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 VAPAQ9P0L0 249 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 KLF15Q9UIH9 416 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-209ENST00000547449 A0A0G2JNG1 304 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms