RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 LIPAP38571 399 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 EPHB3P54753 998 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CSNK2BP67870 215 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 INAVAQ3KP66 663 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 LHX8Q68G74 356 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 PSD2Q9BQI7 771 aa26.14■■□□□ 1.78
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SH3BP2-221ENST00000511747 BTNL2Q9UIR0 455 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 FUT4P22083 530 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 TUBA1BP68363 451 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 RAE1P78406 368 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNC3Q14003 757 aa26.1■■□□□ 1.77
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