RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CES5AQ6NT32 575 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NINQ8N4C6 2090 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC28A1O00337 649 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CREG1O75629 220 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FTH1P02794 183 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STATHP02808 62 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSHRP23945 695 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH4A1P30038 563 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP12P39900 470 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAB4Q2WGN9 574 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAFFQ9ULX9 164 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMDP11532 3685 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLCSP50747 726 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL5RAQ01344 420 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E2F2Q14209 437 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFE2L1Q14494 772 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR6Q5GH73 641 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX19Q92543 992 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLYATL1Q969I3 302 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM159Q96B96 161 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB16Q96NS5 453 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCN2Q9UL51 889 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCM1Q15154 2024 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETHE1O95571 254 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT6AP02538 564 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT6BP04259 564 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6P13671 934 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AQP1P29972 269 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT6CP48668 564 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP51Q70EK9 711 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICU2Q8IYU8 434 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITPKCQ96DU7 683 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC32A1Q9H598 525 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO10Q9HD67 2058 aa14.98□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR1P46091 355 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFN3P60673 137 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD47Q08722 323 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BROXQ5VW32 411 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP43Q70EL4 1123 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3GL1Q99961 368 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGR4Q9BXB1 951 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP99D6REC4 459 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOR1BO14657 336 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT9AO14904 365 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADH1CP00326 375 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPPAP01160 153 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD9P21926 228 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPTEP56180 551 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF8Q02556 426 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CADM3Q8N126 398 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4K3Q96R72 315 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBOAT4Q96T53 435 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPT2Q9UMR5 302 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOBPA7XYQ1 873 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFXANKO14593 260 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOD1P00441 154 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCCBP05166 539 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL6P05231 212 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EBLN1P0CF75 366 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMO3P31513 532 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf27AQ580R0 203 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms