RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 TPK1Q9H3S4 243 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 A0A0D9SEW6 157 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 TNFRSF11BO00300 401 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 CDC7O00311 574 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ECI2O75521 394 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 FPR1P21462 350 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 CPN2P22792 545 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 PTGS2P35354 604 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 RORCP51449 518 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 SPARTQ8N0X7 666 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.71□□□□□ -0.85
TNS1-209ENST00000446688 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 GMFGO60234 142 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 HCN1O60741 890 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 BEST1O76090 585 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 IFNGP01579 166 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 MAGEA3P43357 314 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 AP1S2P56377 157 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 GHRHRQ02643 423 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PCDH1Q08174 1060 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 SLC13A2Q13183 592 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TEAD4Q15561 434 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 RAD9AQ99638 391 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 DUSP26Q9BV47 211 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.71□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 XPNPEP2O43895 674 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.866e-9■■■□□ 17.9
TNS1-209ENST00000446688 GKP32189 559 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 SNAPC1Q16533 368 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 FAM110BQ8TC76 370 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PMEPA1Q969W9 287 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 COL21A1Q96P44 957 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ZNF222Q9UK12 451 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 LRP5O75197 1615 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 MYADML2A6NDP7 307 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 FABP12A6NFH5 140 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 LEFTY2O00292 366 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PCDH7O60245 1069 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PRAMEF11O60813 436 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 SLITRK5O94991 958 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 RB1P06400 928 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PFKMP08237 780 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 HOXB2P14652 356 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 GDF5P43026 501 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 RAB30Q15771 203 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 LRRC66Q68CR7 880 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 IRF7Q92985 503 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 FAM72CH0Y354 149 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 COCHO43405 550 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 UPK1BO75841 260 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 CFIP05156 583 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 ANXA8P13928 327 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 DIO3P55073 304 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 CASP9P55211 416 aa9.7□□□□□ -0.86
TNS1-209ENST00000446688 PIGFQ07326 219 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms