RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 NEK5Q6P3R8 708 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 Q6ZVU0 165 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 RBFAQ8N0V3 343 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 OR2T29Q8NH02 315 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 FATE1Q969F0 183 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 F5P12259 2224 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 LAMA1P25391 3075 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 ETFAP13804 333 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 COX10Q12887 443 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 ZNF846Q147U1 533 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 19.9
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THBS3-201ENST00000368378 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 PKP4Q99569 1192 aa8.59□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 FEVQ99581 238 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 FZD4Q9ULV1 537 aa8.59□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 E7EQ34 232 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 SNPHO15079 494 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 TLL1O43897 1013 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 SSTR4P31391 388 aa8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 COPZ1P61923 177 aa8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 TAGAPQ8N103 731 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 STK40Q8N2I9 435 aa8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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THBS3-201ENST00000368378 ZNF347Q96SE7 839 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 PHOX2BQ99453 314 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 CEP44Q9C0F1 390 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 RMND5AQ9H871 391 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 SNX6Q9UNH7 406 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.58□□□□□ -1.04
THBS3-201ENST00000368378 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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