RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATS1Q496A3 300 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKS6Q68DC2 871 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL35Q6PF15 583 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNSTQ6PJW8 725 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 OOSP2Q86WS3 158 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 BBOF1Q8ND07 529 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALML6Q8TD86 181 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 LCN9Q8WX39 176 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ART4Q93070 314 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM136AQ96C01 138 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC39Q96DD0 335 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CERS2Q96G23 380 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFAP36Q96G28 342 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPM1MQ96MI6 270 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAAR9Q96RI9 348 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP3K3Q99759 626 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 MENTQ9BUN1 341 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 XKR8Q9H6D3 395 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 APMAPQ9HDC9 416 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFS1Q9Y697 457 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KNTC1P50748 2209 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSAPA4D1B5 854 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLCD2A6NGC4 264 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDC80O14777 642 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KPNA5O15131 536 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 AHSGP02765 367 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TUBB4AP04350 444 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHRM3P20309 590 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PKLRP30613 574 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALCOCO2Q13137 446 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRB7Q14451 532 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMED2Q15363 201 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM177Q53S58 311 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 AJUBAQ96IF1 538 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD180Q99467 661 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTRCQ99895 268 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDA1Q9BW61 102 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPRY4Q9C004 299 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB17Q9H0T7 212 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLG2Q9UHN1 485 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 POMT2Q9UKY4 750 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 ESYT3A0FGR9 886 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIPSLA2A3N6 862 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRT87PA6NCN2 255 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms