RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356245.7

G3BP1-201, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene G3BP1, Length 2,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-201ENST00000356245 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 FOXJ1Q92949 421 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MED8Q96G25 268 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 KCNC2Q96PR1 638 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TGM5O43548 720 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OR56A5P0C7T3 313 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CD36P16671 472 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TNFRSF1BP20333 461 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 FPR1P21462 350 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 AOAHP28039 575 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SERPINB10P48595 397 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SELENBP1Q13228 472 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CARTPTQ16568 116 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 UGT8Q16880 541 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 XKR6Q5GH73 641 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 GPR156Q8NFN8 814 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OR52J3Q8NH60 311 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZBP1Q9H171 429 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.64□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OR2AG2A6NM03 316 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 A8MU76 341 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OPN1SWP03999 348 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 UGT2B4P06133 528 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CTSAP10619 480 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 LAMP1P11279 417 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 GJA1P17302 382 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 HOXA9P31269 272 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MAGEA2P43356 314 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PPP3CCP48454 512 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TRPC1P48995 793 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TPTEP56180 551 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ABRQ12979 859 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ACOX1Q15067 660 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 P3H2Q8IVL5 708 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MYLIPQ8WY64 445 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TESCQ96BS2 214 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 DUSP21Q9H596 190 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 INSL6Q9Y581 213 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PSMD11O00231 422 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 YY2O15391 372 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CXCL14O95715 111 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MAGP20916 626 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 LHCGRP22888 699 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PTSQ03393 145 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ELMO1Q92556 727 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PROX1Q92786 737 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SCAMP4Q969E2 229 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 LGALS12Q96DT0 336 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 DACH2Q96NX9 599 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.63□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.62□□□□□ -0.55
G3BP1-201ENST00000356245 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms