RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 PELI2Q9HAT8 420 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CCNDBP1O95273 360 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ST6GAL1P15907 406 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 INHBCP55103 352 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SATB2Q9UPW6 733 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TIMM22Q9Y584 194 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF195O14628 629 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 UGDHO60701 494 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CAPN1P07384 714 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CCR8P51685 355 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KANK2Q63ZY3 851 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ADNP2Q6IQ32 1131 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PAQR7Q86WK9 346 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL3Q9UH77 587 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 OR2A25A4D2G3 310 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TLCD2A6NGC4 264 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FKBP9O95302 570 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FGF4P08620 206 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 HGFP14210 728 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SERPINB3P29508 390 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ARFIP2P53365 341 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 REEP5Q00765 189 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RTP5Q14D33 572 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 LIPJQ5W064 366 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PLD3Q8IV08 490 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 FEZF1A0PJY2 475 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 TAF4O00268 1085 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 FFAR3O14843 346 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 HAT1O14929 419 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 AZIN1O14977 448 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 GPR42O15529 346 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CDH3P22223 829 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CCKBRP32239 447 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 HTR6P50406 440 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 IFT88Q13099 833 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 PHF19Q5T6S3 580 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 ADCK2Q7Z695 626 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CCT6BQ92526 530 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CD180Q99467 661 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 EFCAB11Q9BUY7 163 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 A0A0G2JND7 137 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 SLCO1B7G3V0H7 640 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 ZW10O43264 779 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 CTSVO60911 334 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 DCTN3O75935 186 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 HNF4AP41235 474 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 MAVSQ7Z434 540 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 ZMYND15Q9H091 742 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 FAM60AQ9NP50 221 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 PDP2Q9P2J9 529 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 SNX7Q9UNH6 387 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 A8MU76 341 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM53B-201ENST00000280780 HCRTR1O43613 425 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms