RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.08■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa17.08■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 M0QZQ0 153 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 WWP2O00308 870 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 GBAP04062 536 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 NDUFS1P28331 727 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 LINC00471Q8N535 108 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 FLCNQ8NFG4 579 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 OR52B6Q8NGF0 335 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 IFT27Q9BW83 186 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 KCNK13Q9HB14 408 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 CLPXO76031 633 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RASAL1O95294 804 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 JUNP05412 331 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RFC2P35250 354 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF12O95522 483 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TUBA1BP68363 451 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 LIPJQ5W064 366 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TUBA1AQ71U36 451 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 UCK2Q9BZX2 261 aa17.08■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 AKAP11Q9UKA4 1901 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B1P14061 328 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SNAP47Q5SQN1 464 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 POMZP3Q6PJE2 187 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 OR10H5Q8NGA6 315 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 OR4K1Q8NGD4 311 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TP53INP1Q96A56 240 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SP140LQ9H930 580 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RIMKLBQ9ULI2 386 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C6orf47O95873 294 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 LMAN2Q12907 356 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 E2F2Q14209 437 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TEAD2Q15562 447 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 IRF7Q92985 503 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ALPK1Q96QP1 1244 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SORT1Q99523 831 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 COMMD3Q9UBI1 195 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 MYADML2A6NDP7 307 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 FGF18O76093 207 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C4AP0C0L4 1744 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 GLDCP23378 1020 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ACRV1P26436 265 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 AQP11Q8NBQ7 271 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 PDCD10Q9BUL8 212 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF696Q9H7X3 374 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 VMACQ2NL98 169 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RTP2Q5QGT7 225 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SCD5Q86SK9 330 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ANKFN1Q8N957 763 aa17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 DAPL1A0PJW8 107 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ALAS2P22557 587 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 OR4D2P58180 307 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ABRAXAS2Q15018 415 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TAZQ16635 292 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C2orf27AQ580R0 203 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF789Q5FWF6 425 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C6orf141Q5SZD1 244 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 IQCHQ86VS3 1027 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 ISOC1Q96CN7 298 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 C5orf34Q96MH7 638 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 IGSF5Q9NSI5 407 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 BTN3A3O00478 584 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TFPIP10646 304 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 TGFBR2P37173 567 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 BPIFB1Q8TDL5 484 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD7Q96MP8 289 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 REEP4Q9H6H4 257 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 UTS2RQ9UKP6 389 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 AURKAO14965 403 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 AGR2O95994 175 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 S100A1P23297 94 aa17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 RPL10P27635 214 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SCARB2-201ENST00000264896 KDELR2P33947 212 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms