RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 SYT16Q17RD7 645 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 NEPROQ6NW34 567 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MRGPRGQ86SM5 289 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 RBSNQ9H1K0 784 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CHST11Q9NPF2 352 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 E7ENX8 843 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SMAPO00193 183 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZBTB14O43829 449 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TAP2Q03519 686 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CASC4Q6P4E1 433 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF480Q8WV37 535 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CTAGE9A4FU28 777 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 H7BY64 318 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TPSB2P20231 275 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MST1P26927 711 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TPSAB1Q15661 275 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 RPTNQ6XPR3 784 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CENPUQ71F23 418 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC120Q96HB5 630 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CYTH2Q99418 400 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SVILO95425 2214 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 H0YIG0 161 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 HAT1O14929 419 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 HRH2P25021 359 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 HTR1EP28566 365 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CA7P43166 264 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNJ1P48048 391 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CLCN7P51798 805 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNJ11Q14654 390 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 BTBD16Q32M84 506 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ARMC3Q5W041 872 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PLD3Q8IV08 490 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 OR9A4Q8NGU2 314 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGEB16A2A368 324 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 P2RX6O15547 441 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CYC1P08574 325 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 GRNP28799 593 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TERF1P54274 439 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF766Q5HY98 468 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 XKRXQ6PP77 449 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ASB11Q8WXH4 323 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 TTI1O43156 1089 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 AVILO75366 819 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MLYCDO95822 493 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 FGGP02679 453 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 MPC1LP0DKB6 136 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 COX6B1P14854 86 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PTGER4P35408 488 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 CUL1Q13616 776 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PTK6Q13882 451 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ACER2Q5QJU3 275 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 PRELID2Q8N945 189 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC12A4-208ENST00000572010 SPC24Q8NBT2 197 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms