RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STMND1H3BQB6 276 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 E2F3O00716 465 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLX3O60479 287 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPAG7O75391 227 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLGAP3O95886 979 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIK3CGP48736 1102 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF2H2Q13888 395 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HDXQ7Z353 690 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RDH11Q8TC12 318 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MID2Q9UJV3 735 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLLPQ9Y342 182 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APC2O95996 2303 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 G3V2L1 256 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UQCRHP07919 91 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYL2P10916 166 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CREB1P16220 341 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCL6P41182 706 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 XKR6Q5GH73 641 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC63Q8NA47 563 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF31Q96EP0 1072 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR34Q96EX3 536 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCTPQ9UKL6 214 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.93■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FITM1A5D6W6 292 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF749O43361 778 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TYROBPO43914 113 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAMEF4O60810 478 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KATNA1O75449 491 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CXCR2P25025 360 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HERVK_113P63132 956 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IRF8Q02556 426 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDH1Q08174 1060 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHIT1Q13231 466 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBCCQ15814 346 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC126Q96EE4 140 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STARD5Q9NSY2 213 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SRPK3Q9UPE1 567 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACACAQ13085 2346 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRYQ5TBA9 3013 aa22.92■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR1F1O43749 312 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NTRK1P04629 796 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HBQ1P09105 142 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LIPCP11150 499 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASP2P42575 452 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCTRP47872 440 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKAA2P54646 552 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DOC2AQ14183 400 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 E2F2Q14209 437 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP7Q14244 749 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRM7Q14831 915 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.91■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms