RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 RMI1Q9H9A7 625 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.36■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CLOCKO15516 846 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PRSS23O95084 383 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 EGFP01133 1207 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 ASGR2P07307 311 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PCNAP12004 261 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 COX7A2P14406 83 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CKMT2P17540 419 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 WASP42768 502 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SDE2Q6IQ49 451 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 XKR5Q6UX68 686 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CBR4Q8N4T8 237 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 TFAP2CQ92754 450 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.35■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 IGLON5A6NGN9 336 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SOCS2O14508 198 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 MID1O15344 667 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PCDH8O95206 1070 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 ERGP11308 486 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PTPN6P29350 595 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SERPINB1P30740 379 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 NTSR1P30989 418 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.856e-7■■■■□ 21.3
TPTEP1-205ENST00000558085 GZMMP51124 257 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 NFE2L1Q14494 772 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 STARD3Q14849 445 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 METRNLQ641Q3 311 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 KRT78Q8N1N4 520 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PGBD3Q8N328 593 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 FIG4Q92562 907 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM162AQ96A26 154 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PHF12Q96QT6 1004 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 GABRG3Q99928 467 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PIF1Q9H611 641 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 ASF1AQ9Y294 204 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 C5orf42Q9H799 3197 aa20.34■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 KRT87PA6NCN2 255 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 EPN2O95208 641 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CXCR2P25025 360 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 TRIM23P36406 574 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 PLIN5Q00G26 463 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 DMPKQ09013 629 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 UGT8Q16880 541 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 DEFB123Q8N688 67 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SEPHS2Q99611 448 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TPTEP1-205ENST00000558085 CKAP5Q14008 2032 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 FPGTO14772 594 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 ACOX3O15254 700 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 TPST1O60507 370 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 PCCBP05166 539 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 SRFP11831 508 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 TAS2R38P59533 333 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 TDGQ13569 410 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 MYBPC3Q14896 1274 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 CYP2A13Q16696 494 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 LIN52Q52LA3 116 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 CPTPQ5TA50 214 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 KRT80Q6KB66 452 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.33■□□□□ 0.84
TPTEP1-205ENST00000558085 NUDT8Q8WV74 236 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms